Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga11P61622 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga11P61622 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms