Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf13P61216 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf13P61216 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf13P61216 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf13P61216 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Taf13P61216 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms