Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actr1aP61164 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actr1aP61164 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms