Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms