Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Setd4P58467 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd4P58467 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms