Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dpf3P58269 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpf3P58269 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms