Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smpdl3bP58242 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms