Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pdcd5P56812 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdcd5P56812 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms