Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gp1bbP56400 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gp1bbP56400 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms