Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pex2P55098 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pex2P55098 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms