Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aqp4P55088 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms