Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Map3k1P53349 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Map3k1P53349 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms