Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Upp1P52624 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms