Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LumP51885 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LumP51885 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LumP51885 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LumP51885 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LumP51885 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LumP51885 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LumP51885 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms