Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SftpdP50404 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SftpdP50404 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms