Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptx3P48759 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptx3P48759 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms