Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GdnfP48540 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GdnfP48540 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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