Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prox1P48437 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms