Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VdrP48281 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VdrP48281 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VdrP48281 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VdrP48281 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VdrP48281 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VdrP48281 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms