Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TgfaP48030 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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