Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr7P47774 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms