Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SrprbP47758 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SrprbP47758 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms