Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax7P47239 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms