Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zic1P46684 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zic1P46684 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms