Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms