Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ItgavP43406 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms