Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdx2P43241 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms