Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NodalP43021 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NodalP43021 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NodalP43021 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NodalP43021 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NodalP43021 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NodalP43021 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NodalP43021 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms