Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3caP42337 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms