Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv1P41164 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv1P41164 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv1P41164 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Etv1P41164 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Etv1P41164 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms