Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps26aP40336 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms