Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col18a1P39061 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms