Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thbs1P35441 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms