Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms