Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptk2P34152 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms