Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rom1P32958 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rom1P32958 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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