Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cd28P31041 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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