Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tacr1P30548 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tacr1P30548 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms