Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdk4P30285 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms