Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msr1P30204 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msr1P30204 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msr1P30204 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms