Protein–RNA interactions for Protein: P28652

Camk2b, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2bP28652 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Camk2bP28652 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Camk2bP28652 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Camk2bP28652 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms