Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd10P28359 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxd10P28359 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms