Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apex1P28352 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms