Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Defa2P28309 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Defa2P28309 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms