Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LoxP28301 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LoxP28301 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LoxP28301 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LoxP28301 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LoxP28301 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.9 ms