Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gja4P28235 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja4P28235 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms