Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CebpbP28033 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms