Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BrafP28028 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BrafP28028 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BrafP28028 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BrafP28028 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BrafP28028 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BrafP28028 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BrafP28028 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BrafP28028 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BrafP28028 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BrafP28028 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms