Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd247P24161 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cd247P24161 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms