Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria2P23819 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gria2P23819 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms